Torna ai risultati della ricercaBando per assegno di ricerca
| Titolo del progetto di ricerca in italiano | SELEZIONE ROBUSTA DI BIOMARCATORI DA DATI HIGH-THROUGHPUT: INTEGRAZIONE DI CONOSCENZA BIOLOGICA A PRIORI NEGLI ALGORITMI DI CLASSIFICAZIONE |
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| Titolo del progetto di ricerca in inglese | ROBUST BIOMARKER SELECTION FROM GENOMIC HIGH-THROUGHPUT DATA: INTEGRATION OF BIOLOGICAL PRIOR INFORMATION IN CLASSIFICATION ALGORITHM |
| Area CUN | 09 - Ingegneria industriale e dell'informazione |
| S.S.D | - |
| Descrizione sintetica in italiano | L’identificazione robusta di biomarcatori è un passo fondamentale per la diagnosi e il trattamento precoci delle malattie. In genomica, i dati high-throughput vengono spesso usati con questo obiettivo, tuttavia le liste di biomarcatori prodotte da studi diversi in relazione alla stessa malattia sono solo parzialmente sovrapponibili. Questo è dovuto sia alla dimensione dei dataset (pochi soggetti rispetto al numero di variabili misurate), sia alla etereogeneità di malattie complesse quali il cancro o il diabete. Questo progetto si propone di testare l’uso della conoscenza biologica a priori, data ad esempio dai database di annotazione funzionale o di interazione proteina-proteina, per sviluppare metodi per l’ integrazione di conoscenza biologica a priori negli algoritmi di learning, al fine di ottenere liste di biomarcatori più robuste. |
| Descrizione sintetica in inglese | The identification of robust lists of molecular biomarkers related to a disease is a fundamental step for early diagnosis and treatment. High-throughput data are often used at this purpose; however, the lists of the identified biomarkers cannot be reproduced with reasonable reproducibility by different studies, given the dataset size (few subjects with respect to the number of features) and the heterogeneity of the complex diseases such as cancer or diabetes. This project explores the use of different biological information, such as functional annotations and protein-protein interactions, in order to develop methodologies integrating biological prior knowledge in the learning process with the aim to make the lists of biomarkers more robust. |
| Data del bando | 21/11/2011 |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
| Paesi di residenza dei candidati |
Italy |
| Nazionalità dei candidati |
Italy |
| Sito web del bando | http://www.dei.unipd.it/wdyn/?IDsezione=7159 |
| Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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| Nome dell'Ente finanziatore | Università degli Studi di Padova- Dipartimento di Ingegneria dell'Informazione |
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| Tipologia dell'Ente | Public research |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | Padova |
| Sito web | http://ww.dei.unipd.it |
| barbara.dicamillo@dei.unipd.it |
| L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | Fp7/Other |
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| Data di scadenza del bando | 07/12/2011 |
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| Come candidarsi | Other |