Torna ai risultati della ricercaBando per assegno di ricerca
| Titolo del progetto di ricerca in italiano | Caratterizzazione strutturale e termodinamica di siti multipli di legame di substrati nella proteina di transporto RND AcrB in E.coli. |
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| Titolo del progetto di ricerca in inglese | Structural and thermodynamical characterization of multiple-site binding of substrates to the RND transporter AcrB of E.coli. |
| Campo principale della ricerca | Physics |
| Sottocampo della ricerca | Applied physics |
| Area CUN | 02 - Scienze fisiche |
| S.S.D | FIS/07 - FISICA APPLICATA (A BENI CULTURALI, AMBIENTALI, BIOLOGIA E MEDICINA) |
| Descrizione sintetica in italiano | In questo studio ci si prefigge di identificare delle relazioni struttura-attività (SAR) che razionalizzino i dati sperimentali sull’interazione della proteina di trasporto AcrB con una decina circa di composti organici. L’AcrB fa parte del sistema di efflusso AcrA-AcrB-TolC, espressa costitutivamente nei batteri E. coli o S. aenterica, e tra i maggiori responsabili della cosiddetta multiresistenza batterica, ovvero della resistenza simultanea a più antibiotici chimicamente dissimili. L’assegnista è chiamato a svolgere simulazioni di docking, dinamica molecolare classica, e calcolo delle energie libere di legame con la tecnica denominata “Molecular Mechanics/Generalized Born Surface Area (MM/GBSA)”. In aggiunta a tali calcoli, l’assegnista è chiamato a svolgere l’analisi dei dati prodotti dalle simulazioni, che andranno a supporto di report scientifici da compilarsi con cadenza mensile. |
| Descrizione sintetica in inglese | In this study we aim to identify structure-activity relationships (SAR) allowing to rationalize the experimental data on the interaction of the transport protein AcrB with a tenth of organic compounds. AcrB is the molecular engine of the efflux pump Acra-AcrB-TolC, constitutively expressed in bacteria such as E. coli or S. aenterica. This transporter contributes significantly to the onset of multidrug resistance, i.e., the simultaneous resistance to multiple and chemically dissimilar antibiotics. The research fellow is expected to perform docking and molecular dynamics simulations, as well as to perform calculation of free energies of binding by using the "Molecular Mechanics / Generalized Born Surface Area (MM / GBSA)" technique. In addition the fellow is expected to perform the analysis of the simulation data and to write a series of detailed scientific reports every month. |
| Data del bando | 10/12/2015 |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
| Paesi di residenza dei candidati |
EUROPE |
| Nazionalità dei candidati |
EUROPE |
| Sito web del bando | http://dirpersonale.unica.it/concorsi/index.php?page=assegni |
| Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc) |
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| Nome dell'Ente finanziatore | Aziende Chimiche Riunite Angelini Francesco A.C.R.A.F. S.p.A |
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| Tipologia dell'Ente | Small Medium Enterprise |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | Cagliari |
| Sito web | http://www.angelini.it/wps/wcm/connect/it/home |
| vargiu@dsf.unica.it | |
| Telefono | 00390706754911 |
| L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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| Data di scadenza del bando | 31/12/2015 |
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| Come candidarsi | Other |