Torna ai risultati della ricercaBando per assegno di ricerca
| Titolo del progetto di ricerca in italiano | Studio computazionale di sistemi di efflusso batterici. |
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| Titolo del progetto di ricerca in inglese | Computational study of bacterial efflux transporters |
| Campo principale della ricerca | Physics |
| Sottocampo della ricerca | Other |
| Area CUN | 02 - Scienze fisiche |
| S.S.D | FIS/03 - FISICA DELLA MATERIA |
| Descrizione sintetica in italiano | Lo scopo di questa ricerca è studiare l'interazione di composti antimicrobici con sistemi di efflusso batterici. Verranno presi in considerazione composti selezionati sulla base di dati sperimentali biochimici e microbiologici. Si procederà preliminarmente a determinarne le caratteristiche fisico-chimiche con simulazioni QM e MD in solvente esplicito. Successivamente, verranno eseguiti run di ensemble docking con MexB, il principale transporter RND della specie Pseudomonas aeruginosa. A partire dalle pose di docking verranno effettuate simulazioni di dinamica molecolare dei complessi recettore-ligando. Lo studio delle interazioni fra composti e sistemi d'efflusso battarici permette l'identificazione delle regioni critiche per il funzionamento di queste macchine proteiche complesse. |
| Descrizione sintetica in inglese | In this research we aim at investigating the interaction of antimicrobial compounds with bacterial efflux systems. We will consider compounds selected on the basis of biochimical and microbiological data. First, the physico-chemical properties of these molecules will be derived from both QM and MD simulations in explicit water solution. The second step of the study requires ensemble docking simulations of selected compounds interacting with MexB, the major RND transporter in Pseudomonas aeruginosa. Starting from selected docking poses, molecular dynamics simulations of receptor-ligand complexes will be performed. This study will provide insights into features that are crucial for the functioning of these complex molecular machines. |
| Data del bando | 03/03/2021 |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
| Paesi di residenza dei candidati |
EUROPE |
| Nazionalità dei candidati |
EUROPE |
| Sito web del bando | https://dirpersonale.unica.it/concorsi/?page=assegni&bando=1100 |
| Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc) |
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| Nome dell'Ente finanziatore | Dipartimneto di Fisica |
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| Tipologia dell'Ente | Other |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | Cagliari |
| Sito web | https://www.unica.it/unica/it/dip_fisica.page |
| giuliano.malloci@dsf.unica.it | |
| Telefono | 0706753191 |
| L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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| Data di scadenza del bando | 23/03/2021 |
|---|---|
| Come candidarsi | Other |