Torna ai risultati della ricercaBando per assegno di ricerca
| Titolo del progetto di ricerca in italiano | Realizzazione di una applicazione web per la predizione di strutture di complessi proteina-molecola di interesse biomedico |
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| Titolo del progetto di ricerca in inglese | Development of a webserver to predict the structure of protein-ligand complexes of biomedical relevance. |
| Campo principale della ricerca | Physics |
| Sottocampo della ricerca | Applied physics |
| Area CUN | 02 - Scienze fisiche |
| S.S.D | FIS/07 - FISICA APPLICATA (A BENI CULTURALI, AMBIENTALI, BIOLOGIA E MEDICINA) |
| Descrizione sintetica in italiano | Gli obiettivi del progetto di ricerca riguardano lo sviluppo di: i) un protocollo computazionale basato su metodi di campionamento avanzato delle configurazioni di proteine, per migliorare la predizione delle strutture di complessi formati tra proteine e molecole generiche; ii) un database di strutture di proteine di interesse farmacologico (circa 40) generate tramite l’algoritmo suddetto; iii) la realizzazione di un’applicazione web che implementi in maniera semplice e automatica il protocollo di cui al punto i). Il titolare dell’assegno si occuperà in particolare di sviluppare i punti ii) e iii), mentre il punto i) verrà affidato ad un secondo assegnista. Sono richieste competenze informatiche sui database relazionali e sulla realizzazione di siti web. Inoltre, sono desiderabili conoscenze sulle tecniche di docking molecolare, dinamica molecolare, analisi a clusters; scripting nei linguaggi bash, tcl, python. |
| Descrizione sintetica in inglese | The goals of the research project are to develop: i) a computational protocol based on advanced methods to sample protein configurations, in order to improve the prediction of the structures of complexes formed between these proteins and generic molecules; ii) a database of protein structures of pharmacological interest (about 40) generated through the aforementioned algorithm; iii) the creation of a web application that implements the protocol referred to at point i) in a simple and automatic manner. The fellow will be responsible for points ii) and iii), while point i) will be entrusted to a second fellow. Skills are required on the creation and management of websites and relational databases. Desirable skills include familiarity with molecular docking, molecular dynamics, and clusters analysis techniques, as well as scripting in bash, tcl, python languages. |
| Data del bando | 29/06/2022 |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
| Paesi di residenza dei candidati |
EUROPE |
| Nazionalità dei candidati |
EUROPE |
| Sito web del bando | https://dirpersonale.unica.it/concorsi/index.php?page=assegni |
| Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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| Nome dell'Ente finanziatore | Università di Cagliari |
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| Tipologia dell'Ente | Public research |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | Cagliari |
| Sito web | http://www.unica.it |
| vargiu@dsf.unica.it |
| L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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| Data di scadenza del bando | 19/07/2022 |
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| Come candidarsi | Other |