Bandi per ricercatori a tempo determinato

ROMA "La Sapienza"

Bando per ricercatore a tempo determinato
Descrizione posizione
Titolo del progetto di ricerca in italiano In-silico investigation of protein-protein interactions
Titolo del progetto di ricerca in inglese In-silico investigation of protein-protein interactions
Descrizione sintetica in italiano In sintesi l'obiettivo principale di questo progetto sarà lo sviluppo di un metodo teorico-computazionale basato sul criterio di complementarità, considerando sia la forma che le proprietà energetiche delle due regioni superficiali in un modo combinato e compatto. In particolare, l'attività di ricerca del candidato sarà focalizzata sia sulle interazioni proteina-proteina che proteina-small molecole
Descrizione sintetica in inglese the main principle of this project will be the development of a theoretical-computational method based on the complementarity criterion, considering both the shape and the energetic properties of the two surface regions in a combined and compact way. In particular, the research question of the candidate will be focused both on the interactions between protein-protein and molecule-small molecule
Descrizione del bando in italiano Nonostante l'importanza del legame molecolare, i meccanismi che garantiscono il riconoscimento e il legame tra due molecole biologiche non sono ancora completamente compresi. Lo sviluppo di un metodo computazionale in grado di risolvere il problema dell'aggancio alle proteine ​​e alle proteine ​​è uno dei punti focali dell'attività nella biofisica computazionale e nella biologia strutturale.
L'obiettivo principale di questo progetto sarà lo sviluppo di un metodo teorico e computazionale basato sul criterio di complementarità, considerando sia la forma che le proprietà energetiche delle due regioni di superficie in modo combinato e compatto. In particolare, l'attività di ricerca del candidato si concentrerà su interazioni sia proteina-proteina che proteina-ligando. Il candidato dovrà sviluppare un algoritmo in grado di esplorare lo spazio di patch sulle due superfici molecolari e valutare la forma e la complementarità elettrostatica, con l'ipotesi che con l'aumento della complementarietà stimata aumenterebbe la probabilità di interazione tra le due molecole.
Descrizione del bando in inglese Despite the importance of molecular binding, the mechanisms that guarantee the recognition and binding between two biological molecules are not yet fully understood. The development of computational method able to solve the protein-protein docking problem is one of the focal points of activity in computational biophysics and structural biology.
The main objective of this project will be to develop a theoretical and computational method based on the complementarity criterion, considering both shape and energy properties of the two surface regions in a combined and compact manner. In particular, the candidate’s research activity will be focused on both protein-protein and protein-small ligand interactions. The candidate will be required to develop an algorithm able to explore the patch space on the two molecular surfaces and evaluate the shape and electrostatics complementarity, under the hypothesis that with the increase of the estimated complementarity the probability of interaction between the two molecules would increase.
Numero posti 1
Campo principale della ricerca Physics
Sottocampo della ricerca Other
Destinatari del bando (of target group) Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate)
Data del bando 19/12/2019

 

FP7 / PEOPLE / Marie Curie Actions
Research Framework Programme / Marie Curie Actions No

 

Dettagli dell'impiego
Tipo di contratto Temporary
Tempo Full-time
Ore settimanali 36
Organizzazione/Ente Sapienza Università
Paese (dove si svolgerà l'attività) ITALY
Città Roma

 

Contatto presso l'Organizzazione/Ente
Organizzazione/Ente Sapienza Università Roma
Tipo Academic
Facoltà/Dipartimento/Laboratorio di ricerca Dipartimento di Fisica
Paese ITALY
Stato/Provincia Roma
Città Roma
Codice postale 00185
Indirizzo Piazzale Aldo Moro, 5
E-mail daria.varone@uniroma1.it
Sito web https://web.uniroma1.it/trasparenza/bando-248/19-silico-investigation-protein-protein-interactions
Telefono 06 49914379

 

Dettagli per la candidatura
Data prevedibile per l'assunzione 01/10/2020
Data di scadenza del bando 18/01/2020
Come candidarsi procedure.fisica@cert.uniroma1.it

 

Titoli di studio richiesti
Laurea PhD or equivalent
Ambito della laurea Physics

 

Esperienze di ricerca richieste
Campo principale della ricerca Physics
Sottocampo della ricerca Other
Anni di esperienza richiesti 4

 

Lingue richieste
Lingua ENGLISH
Livello di conoscenza della lingua Good