Descrizione posizione

Titolo del progetto di ricerca in italiano	Simulazioni atomistiche dei meccanismi di cancello in canali ionici biologici
Titolo del progetto di ricerca in inglese	Atomistic simulation of the gating mechanisms of biological ion channels
Descrizione sintetica in italiano	La ricerca verterà sull’investigazione dei meccanismi di cancello in specifici canali ionici di interesse biomedico, con particolare riguardo a selezionati canali del calcio e del potassio. Il Ricercatore dovrà utilizzare simulazioni atomistiche avanzate e modelli “coarse grained” al fine di caratterizzare qualitativamente e quantitativamente, in termini di energia libera, i meccanismi di cancello per selezionati canali ionici, con particolare riferimento al meccanismo del cancello idrofobo. Inoltre, il Ricercatore investigherà tramite mutagenesi computazionale l’origine molecolare di specifiche canalopatie legate alla mutata capacità di cancello dei canali ionici studiati.
Descrizione sintetica in inglese	This research will focus on the investigation of gating mechanisms in specific ion channels of biomedical interest, in particular, calcium and potassium channels. The researcher will use advanced atomistic simulations and coarse-grained models in order to characterize qualitatively and quantitatively, in terms of free energy, the mechanisms of gating of selected ion channels, in particular, focusing on the hydrophobic gating mechanism. In addition, the researcher will investigate via computational mutagenesis the molecular origin of specific channelopathies linked to the alteration of gating capabilities of the investigated channels.
Descrizione del bando in italiano	Repertorio n. 105/2020 Prot. n. 2019 del 01/07/2020 La ricerca verterà sull’investigazione dei meccanismi di cancello in specifici canali ionici di interesse biomedico, con particolare riguardo a selezionati canali del calcio e del potassio. Il Ricercatore dovrà utilizzare simulazioni atomistiche avanzate e modelli “coarse grained” al fine di caratterizzare qualitativamente e quantitativamente, in termini di energia libera, i meccanismi di cancello per selezionati canali ionici, con particolare riferimento al meccanismo del cancello idrofobo. Inoltre, il Ricercatore investigherà tramite mutagenesi computazionale l’origine molecolare di specifiche canalopatie legate alla mutata capacità di cancello dei canali ionici studiati. La ricerca si svolgerà all’interno del progetto ERC HyGate in un ambito fortemente multidisciplinare all’interfaccia tra l’ingegneria, la fisica e la biologia. Il Ricercatore parteciperà attivamente a tale progetto contribuendo ad identificare criteri biomimetici per lo sviluppo di canali artificiali.
Descrizione del bando in inglese	Repertorio n. 105/2020 Prot. n. 2019 del 01/07/2020 This research will focus on the investigation of gating mechanisms in specific ion channels of biomedical interest, in particular, calcium and potassium channels. The researcher will use advanced atomistic simulations and coarse-grained models in order to characterize qualitatively and quantitatively, in terms of free energy, the mechanisms of gating of selected ion channels, in particular, focusing on the hydrophobic gating mechanism. In addition, the researcher will investigate via computational mutagenesis the molecular origin of specific channelopathies linked to the alteration of gating capabilities of the investigated channels. The research will be developed in the framework of the ERC HyGate project in a strongly multidisciplinary environment at the interface between engineering, physics, and biology. The researcher will actively participate in the project, contributing to identify biomimetic criteria for the design of artificial nanopores.
Numero posti	1
Settore Concorsuale	09/A1 - INGEGNERIA AERONAUTICA, AEROSPAZIALE E NAVALE
S.S.D	ING-IND/06 - FLUIDODINAMICA
Destinatari del bando (of target group)	Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc)
Benefits (in italiano) (congedo parentale, giorni di vacanza, etc.)	congedo parentale, giorni di vacanza
Benefits (in inglese) (parental leave, vacation days, etc.)	parental leave, vacation days
Data del bando	10/07/2020

 

FP7 / PEOPLE / Marie Curie Actions

Research Framework Programme / Marie Curie Actions	No

 

Dettagli dell'impiego

Tipo di contratto	Temporary
Tempo	Full-time
Ore settimanali	36
Organizzazione/Ente	DIPARTIMENTO DI INGEGNERIA MECCANICA E AEROSPAZIALE - UNIVERSITA' LA SAPIENZA ROMA
Paese (dove si svolgerà l'attività)	ITALY
Stato/Provincia	ROMA
Città	ROMA
Codice postale	00184
Indirizzo	Via Eudossiana, 18

 

Contatto presso l'Organizzazione/Ente

Organizzazione/Ente	UNIVERSITA' DEGLI STUDI DI ROMA LA SAPIENZA
Tipo	Academic
Facoltà/Dipartimento/Laboratorio di ricerca	DIPARTIMENTO DI INGEGNERIA MECCANICA E AEROSPAZIALE
Paese	ITALY
Stato/Provincia	ROMA
Città	ROMA
Codice postale	00184
Indirizzo	Via Eudossiana, 18
E-mail	dima@cert.uniroma1.it
Sito web	https://web.uniroma1.it/trasparenza/bandiconcorso

 

Dettagli per la candidatura

Data prevedibile per l'assunzione	02/11/2020
Data di scadenza del bando	10/08/2020
Come candidarsi	dima@cert.uniroma1.it

 

Titoli di studio richiesti

Laurea	PhD or equivalent
Ambito della laurea	Engineering

 

Esperienze di ricerca richieste

Campo principale della ricerca	Engineering
Sottocampo della ricerca
Anni di esperienza richiesti	5

 

Lingue richieste

Lingua	ENGLISH
Livello di conoscenza della lingua	Excellent

 

Requisiti aggiuntivi

Competenze richieste in italiano	Esperienza scientifica e/o tecnologica richiesta, in relazione alla linea di ricerca su cui il ricercatore dovrà applicarsi: esperienza nella progettazione e conduzione di ricerche originali su problematiche scientifiche relative ai temi inerenti all’argomento della ricerca. Capacità di svolgere simulazioni atomistiche in ambito biofisico. Conoscenza di tecniche per la simulazione di eventi rari. Comprovata capacità di ideazione e gestione di progetti computazionali di grande taglia (Tier 0). Organizzazione di convegni di carattere scientifico in Italia o all’estero
Competenze richieste in inglese	Experience in designing and conducting original research on scientific problems concerning the research topic. Capacity to perform atomistic simulations of biophysical systems. Knowledge of rare event methods. Documented capacity to write and manage large size computational projects (Tier 0). Organization of scientific workshops in Italy or abroad.
Requisiti specifici in italiano	1. Numero di Pubblicazioni selezionabili per la valutazione di merito: non superiore a 12 pubblicazioni censite su banche dati internazionali (ISI WoS e Scopus) 2. Lingua straniera oggetto di accertamento delle competenze linguistiche scientifiche del candidato: inglese 3. Titoli preferenziali: -curriculum scientifico professionale idoneo allo svolgimento dell’attività di ricerca; - pubblicazioni censite su banche dati internazionali (ISI WoS e Scopus), in qualità di autore/coautore su temi inerenti all’argomento della ricerca; - partecipazione a progetti di ricerca europei, competenze in ambienti “High performance computing” (HPC), conoscenza di database biologici; - comprovata partecipazione a gruppi di ricerca nazionali ed internazionali, documentata da lettere di referenza rilasciate dai responsabili di tali gruppi e da eventuali pubblicazioni prodotte da tali collaborazioni
Requisiti specifici in inglese	1. Number of publications to be selected for the evaluation: no more than 12 publications present in internationally recognised databases (ISI WoS and Scopus) 2. Foreign language whose scientific knowledge will be tested: English 3. Preferential titles: - scientific curriculum apt to perform the research - publications present in internationally recognised databases (ISI WoS and Scopus) as author or coauthor coherent with the research subject - participation in European research projects, knowledge of high performance computing environments, knowledge of biological databases - participation in national and International research groups, documented by reference letters by the responsible of such groups and by publications ensuing from such collaborations