Descrizione posizione

Titolo del progetto di ricerca in italiano	Analisi di dati high-throughput sequencing e generazione di modelli teorici predittivi per RNA codificanti (e non) nell’ambito del neurosviluppo e di patologie quali Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS) e DiGeorge syndrome (DGS)
Titolo del progetto di ricerca in inglese	Analysis of high-throughput sequencing data and generation of predictive theoretical models for coding (and non-coding) RNA in the context of neurodevelopment and diseases like Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS) and DiGeorge syndrome (DGS)
Descrizione sintetica in italiano	Scopo del progetto è la comprensione delle reti di interazione molecolari coinvolte nei processi di sviluppo neurologico, nonché nell'insorgenza e progressione di malattie neurodegenerative, come la Sclerosi Laterale Amiotrofica, e disturbi multisistemici che influenzano l'esito dello sviluppo neurologico, come la sindrome di DiGeorge. Tali reti saranno studiate attraverso approcci computazionali per l’analisi di dati di sequenziamento high-throughput e per la caratterizzazione funzionale di molecole di RNA codificanti e non, con particolare attenzione a lncRNA e circRNA. Le interazioni proteina-RNA, proteina-DNA e RNA-RNA alla base di tali reti saranno ampiamente studiate attraverso l'integrazione di evidenze sperimentali e predizione computazionale. . Il bando è scaricabile dal seguente link: https://web.uniroma1.it/trasparenza/dettaglio_bando_albo/176921
Descrizione sintetica in inglese	The aim of the project is to gain insights into the molecular interaction networks involved in neurodevelopmental processes, as well as in the onset and progression of neurodegenerative diseases, like Amyotrophic Lateral Sclerosis, and multi-system disorders that that influence the neurodevelopmental outcome, like DiGeorge syndrome. Such networks will be studied through computational approaches for the analysis of high-throughput sequencing data and for the functional characterization of coding and non-coding RNA molecules, especially lncRNAs and circRNAs. Protein-RNA, Protein-DNA and RNA-RNA interactions will be extensively investigated through the integration of experimental evidence and computational prediction. You can find the documentation required at: https://web.uniroma1.it/trasparenza/dettaglio_bando_albo/176921
Numero posti	1
Campo principale della ricerca	Biological sciences
Sottocampo della ricerca	Biology
Settore Concorsuale	05/E1 - BIOCHIMICA GENERALE
S.S.D	BIO/10 - BIOCHIMICA
Destinatari del bando (of target group)	Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc)
Data del bando	21/05/2021

 

FP7 / PEOPLE / Marie Curie Actions

Research Framework Programme / Marie Curie Actions	H2020/ERC
Marie Curie Job Reference Number	855923

 

Dettagli dell'impiego

Tipo di contratto	Temporary
Tempo	Full-time
Ore settimanali	36
Organizzazione/Ente	Sapienza, Università di Roma
Paese (dove si svolgerà l'attività)	ITALY
Città	Roma
Codice postale	00185
Indirizzo	p.le Aldo Moro, 5

 

Contatto presso l'Organizzazione/Ente

Organizzazione/Ente	Sapienza, Università di Roma
Tipo	Academic
Facoltà/Dipartimento/Laboratorio di ricerca	Dipartimento di Biologia e Biotecnologie
Paese	ITALY
Città	Roma
E-mail	concorsi-bbcd@cert.uniroma1.it
Sito web	http://bbcd.bio.uniroma1.it/bbcd/

 

Dettagli per la candidatura

Data di scadenza del bando	20/06/2021
Come candidarsi	concorsi-bbcd@cert.uniroma1.it

 

Titoli di studio richiesti

Laurea	PhD or equivalent
Ambito della laurea	Biological sciences

 

Esperienze di ricerca richieste

Campo principale della ricerca	Biological sciences
Sottocampo della ricerca	Biology
Anni di esperienza richiesti	5

 

Lingue richieste

Lingua	ENGLISH
Livello di conoscenza della lingua	Excellent

 

Requisiti aggiuntivi

Competenze richieste in italiano

Esperienza documentata di analisi dati RNA-Seq, CLIP-Seq e ChIP-Seq prodotti a partire da tecnologie Illumina e possibilmente Nanopore sequencing. - Padronanza delle metodologie in silico per lo studio della struttura e funzione di molecole di RNA non codificanti, specialmente lncRNA e circRNA: allineamento, identificazione di motivi, predizione della struttura secondaria, analisi di conservazione evolutiva, predizione di interazione con proteine ed altri RNA.

Competenze richieste in inglese

Documented experience in the analysis of RNA-Seq, CLIP-Seq, ChIP-Seq data produced using Illumina technologies and, possibly, Nanopore sequencing. - Mastery of in silico methodologies for the study of the structure and function of non-coding RNA molecules, especially lncRNAs and circRNAs: alignment, identification of motifs, prediction of the secondary structure, evolutionary conservation analysis, prediction of interaction with proteins and other RNAs.